Фури-кури: Шугейз

События аниме происходят через десять лет после FLCL Alternative. Главными персонажами являются подростки - юноша и девушка, которые учатся в старшей школе. Их повседневная жизнь сталкивается с необычными явлениями, характерными для вселенной FLCL. В центре сюжета лежит взаимодействие этих двух персонажей с окружающим миром, который постепенно начинает выходить за рамки привычной реальности.

Развитие истории строится вокруг появления загадочных событий и объектов, нарушающих обыденность школьной жизни. Персонажи вынуждены разбираться в природе происходящего, сталкиваясь с последствиями событий предыдущих частей сериала. Ключевая интрига заключается в том, как именно изменился мир за прошедшее десятилетие и какую роль в новых событиях сыграют главные герои.