Галактический экспресс 999: Вечная фантазия

Спустя год после установления власти людей на Земле социальное неравенство сохранилось. Правящая элита продолжает угнетать простых граждан. Тэцуро Хосино открыто выражает недовольство существующими порядками, за что попадает в тюрьму. Ему грозит смертная казнь за совершённые проступки. В этот момент прибывает Галактический экспресс с Мэйтел на борту, который спасает юношу.

Тэцуро узнаёт, что причиной происходящего на Земле является Владыка Тьмы. Юноша ставит перед собой цель остановить его и спасти планету. Дальнейшие события связаны с путешествием главного героя и его попытками противостоять антагонисту, чтобы изменить ситуацию на Земле.