Мегамен Икс: День Сигмы

Действие разворачивается в двадцать втором веке. Люди сосуществуют с реплоидами — человекоподобными роботами, созданными учёным по имени Каин. Целью их разработки было облегчение повседневной жизни человека. Однако со временем создание Каина стало представлять угрозу для человечества. Реплоид Сигма, занимавший руководящую позицию среди других роботов, организовал восстание.

Для подавления восстания требуются усилия двух напарников — Икса и Зеро. Они обладают возможностями, позволяющими противостоять Сигме и его сторонникам. Исход конфликта между людьми и реплоидами зависит от действий этих персонажей.