Хотаро Орэки руководствуется принципом экономии энергии — он избегает действий, которые не являются необходимыми. По просьбе старшей сестры он присоединяется к клубу классической литературы, который находится под угрозой закрытия из-за нехватки участников. В клубе Орэки знакомится с Эру Читандой — девушкой, которая проявляет повышенную любознательность и часто задает вопросы. Позже к ним присоединяется Сатоши Фукубэ, одноклассник Орэки, обладающий хорошей памятью. Четвертым участником
Сюжет разворачивается на острове Ивадо, расположенном недалеко от Окинавы, где усиливаются сепаратистские настроения. На острове проживает старый доктор Тошио Фукаи вместе с 13-летним мальчиком Ао Фукаи, который в детстве потерял родителей — его отец погиб, а мать была похищена неизвестными 10 лет назад. Рядом с ними живет подруга Ао, Нару Арата, обладающая мистической силой «Юта», пробудившейся после несчастного случая в детстве. На острове появляется таинственная организация под названием
Мэдака Куроками становится президентом школьного совета старшей школы. На новом посту она устанавливает ящик для отзывов и предложений, который ученики называют «Ящиком Мэдаки». Она предлагает учащимся отправлять письма с любыми проблемами и обязуется решать любые вопросы. Поскольку Мэдака набрала 98% голосов на выборах, она оказывается единственным членом совета. Она просит своего друга детства Зэнкичи Хитоёши помочь ей, и тот неохотно соглашается вступить в совет. Позже Мэдака привлекает ещё
Группа поп-идолов под названием «АКБ0048» действует в галактике, где после Мировой войны начала 21 века человечество покинуло Землю и расселилось на других планетах. С введением Звездного календаря развлечения и музыка стали подвергаться жесткому контролю, а на некоторых планетах массовые мероприятия были запрещены из-за их способности мотивировать население. «АКБ0048» игнорирует эти ограничения и проводит выступления на запретных территориях, ссылаясь на наследие исторической группы «АКБ48»,
Эба Юдзуки принимает решение поступить в старшую школу, расположенную в сельской местности. Она вселяется в дом Кирисимы Харуты, несмотря на его возражения. Харуте приходится примириться с присутствием нахлебницы в своем жилище. Основной проблемой для Харуты становится необходимость скрывать факт сожительства от Кандзаки Нанами, к которой он испытывает романтические чувства. Сюжет строится вокруг попыток Харуты сохранить эту тайну и одновременно уживаться с неожиданной соседкой.
Бонусные эпизоды связаны с 9-м и 11-м томами манги. Они были выпущены в качестве дополнительного материала для эксклюзивных изданий. Сюжеты этих эпизодов расширяют основную историю, фокусируясь на отдельных персонажах и их взаимодействиях. В одном из эпизодов показаны повседневные ситуации, которые не вошли в основной сюжет. Другой эпизод раскрывает детали предыстории некоторых героев, что позволяет лучше понять их мотивацию. События разворачиваются в рамках уже известного сеттинга, но не