Семнадцатилетний Юити Эдзаки госпитализирован с гепатитом А. Из-за заразности заболевания он изолирован от семьи и знакомых. В процессе выздоровления у пациента появляется свободное время, которое он начинает проводить в ночных прогулках по больнице. Медперсонал замечает нарушения режима, но это не останавливает Юити. Во время одного из таких походов он встречает Рику Акибу - девушку с тяжелым заболеванием сердца, которая провела значительную часть жизни в медицинских учреждениях. У Рики

На спутнике планеты Хирайз похищают Мэйтел. Тэцуро Хосино пытается её спасти, но в результате Галактический экспресс 999 терпит крушение на планете. Для спасения отправляют отряд Космических Охранных Сил, в составе которого находится Манабу Юки. Тэцуро и Манабу предстоит спасти Мэйтел и Проводника, который был пойман во время крушения. Также им нужно выяснить, что скрывает эта планета и почему её исключили из галактической карты.