Ханако, призрак с внеклассными историями

В академии Камомэ существует семь школьных тайн, одна из которых связана с призраком по имени Ханако-кун. Согласно слухам, у этого призрака появился помощник — первокурсница старшей школы Нэнэ Ясиро. Ханако и Ясиро совместно расследуют различные мистические происшествия в академии, поддерживая баланс между миром людей и сверхъестественных существ.

В свободное от расследований время персонажи занимаются повседневными делами, взаимодействуя с одноклассниками Ясиро и призрачными сущностями, невидимыми для обычных людей. Эти существа постоянно появляются на территории школы, создавая дополнительные ситуации, которые требуют внимания главных героев.